MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p06

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018489	AGA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558810
2	NC_018489	ACA	2	6	409	414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558810
3	NC_018489	AGA	2	6	491	496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558810
4	NC_018489	A	7	7	551	557	100 %	0 %	0 %	0 %	402558810
5	NC_018489	AAT	2	6	639	644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558811
6	NC_018489	A	6	6	648	653	100 %	0 %	0 %	0 %	402558811
7	NC_018489	AG	3	6	662	667	50 %	0 %	50 %	0 %	402558811
8	NC_018489	T	7	7	672	678	0 %	100 %	0 %	0 %	402558811
9	NC_018489	TGAA	2	8	694	701	50 %	25 %	25 %	0 %	402558811
10	NC_018489	GAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558811
11	NC_018489	GT	3	6	776	781	0 %	50 %	50 %	0 %	402558811
12	NC_018489	ACT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558812
13	NC_018489	ATG	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558812
14	NC_018489	GAG	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558812
15	NC_018489	A	6	6	1555	1560	100 %	0 %	0 %	0 %	402558812
16	NC_018489	AGA	2	6	1658	1663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
17	NC_018489	TA	3	6	1693	1698	50 %	50 %	0 %	0 %	402558812
18	NC_018489	GAA	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
19	NC_018489	GTCCA	2	10	1755	1764	20 %	20 %	20 %	40 %	402558812
20	NC_018489	TAA	2	6	1790	1795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558812
21	NC_018489	TAAT	2	8	1804	1811	50 %	50 %	0 %	0 %	402558812
22	NC_018489	AT	3	6	1818	1823	50 %	50 %	0 %	0 %	402558812
23	NC_018489	TTTC	2	8	1830	1837	0 %	75 %	0 %	25 %	402558812
24	NC_018489	AGA	2	6	1862	1867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
25	NC_018489	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558812
26	NC_018489	CAAT	2	8	2066	2073	50 %	25 %	0 %	25 %	402558812
27	NC_018489	AAG	2	6	2145	2150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558812
28	NC_018489	GCG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558812
29	NC_018489	A	6	6	2253	2258	100 %	0 %	0 %	0 %	402558812
30	NC_018489	AGAC	2	8	2293	2300	50 %	0 %	25 %	25 %	402558812
31	NC_018489	TTA	2	6	2326	2331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558812
32	NC_018489	GAA	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558813
33	NC_018489	GAAA	2	8	3785	3792	75 %	0 %	25 %	0 %	402558813
34	NC_018489	GGAA	2	8	3846	3853	50 %	0 %	50 %	0 %	402558813
35	NC_018489	ACA	2	6	3865	3870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558813
36	NC_018489	CTA	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558813
37	NC_018489	A	7	7	3954	3960	100 %	0 %	0 %	0 %	402558813
38	NC_018489	A	6	6	3983	3988	100 %	0 %	0 %	0 %	402558813
39	NC_018489	AT	3	6	3996	4001	50 %	50 %	0 %	0 %	402558813
40	NC_018489	ATT	2	6	4003	4008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558813
41	NC_018489	T	7	7	4028	4034	0 %	100 %	0 %	0 %	402558813
42	NC_018489	A	6	6	4039	4044	100 %	0 %	0 %	0 %	402558813
43	NC_018489	ACA	2	6	4049	4054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558813
44	NC_018489	TGT	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558813
45	NC_018489	TAA	2	6	4084	4089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558813
46	NC_018489	TCT	2	6	4200	4205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558814
47	NC_018489	TAG	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558814
48	NC_018489	CAA	2	6	4443	4448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558814
49	NC_018489	TTG	2	6	4513	4518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558814
50	NC_018489	A	6	6	4529	4534	100 %	0 %	0 %	0 %	402558814
51	NC_018489	GT	3	6	4546	4551	0 %	50 %	50 %	0 %	402558814
52	NC_018489	ATA	2	6	4558	4563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558814
53	NC_018489	TATC	2	8	4627	4634	25 %	50 %	0 %	25 %	402558814
54	NC_018489	ATGA	2	8	4638	4645	50 %	25 %	25 %	0 %	402558814
55	NC_018489	TAT	2	6	4670	4675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
56	NC_018489	AGG	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558814
57	NC_018489	AAC	2	6	4696	4701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558814
58	NC_018489	ATCG	2	8	4752	4759	25 %	25 %	25 %	25 %	402558814
59	NC_018489	TACAG	2	10	4767	4776	40 %	20 %	20 %	20 %	402558814
60	NC_018489	TTA	2	6	4798	4803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
61	NC_018489	GTC	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558814
62	NC_018489	TTA	2	6	4867	4872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558814
63	NC_018489	CTT	2	6	4892	4897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558814
64	NC_018489	ACT	2	6	4976	4981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558814
65	NC_018489	A	6	6	5009	5014	100 %	0 %	0 %	0 %	402558814
66	NC_018489	CTGG	2	8	5236	5243	0 %	25 %	50 %	25 %	402558815
67	NC_018489	GAA	2	6	5316	5321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
68	NC_018489	TCT	2	6	5403	5408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
69	NC_018489	TTA	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
70	NC_018489	CAA	2	6	5442	5447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558815
71	NC_018489	AAT	2	6	5460	5465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558815
72	NC_018489	TTC	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
73	NC_018489	TATG	2	8	5528	5535	25 %	50 %	25 %	0 %	402558815
74	NC_018489	AAGCA	2	10	5557	5566	60 %	0 %	20 %	20 %	402558815
75	NC_018489	GTATA	2	10	5585	5594	40 %	40 %	20 %	0 %	402558815
76	NC_018489	A	6	6	5752	5757	100 %	0 %	0 %	0 %	402558815
77	NC_018489	ATG	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
78	NC_018489	CAAA	2	8	5961	5968	75 %	0 %	0 %	25 %	402558815
79	NC_018489	A	6	6	5973	5978	100 %	0 %	0 %	0 %	402558815
80	NC_018489	AGCA	2	8	5995	6002	50 %	0 %	25 %	25 %	402558815
81	NC_018489	A	6	6	6009	6014	100 %	0 %	0 %	0 %	402558815
82	NC_018489	TTA	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
83	NC_018489	GAA	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
84	NC_018489	AAC	2	6	6151	6156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558815
85	NC_018489	TTA	2	6	6234	6239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
86	NC_018489	CGA	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558815
87	NC_018489	TGAAT	2	10	6305	6314	40 %	40 %	20 %	0 %	402558815
88	NC_018489	ATG	3	9	6388	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
89	NC_018489	TAT	2	6	6417	6422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
90	NC_018489	CAT	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
91	NC_018489	TGA	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
92	NC_018489	ATG	2	6	6526	6531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
93	NC_018489	TA	3	6	6591	6596	50 %	50 %	0 %	0 %	402558815
94	NC_018489	A	6	6	6641	6646	100 %	0 %	0 %	0 %	402558815
95	NC_018489	AGA	2	6	6719	6724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
96	NC_018489	CTT	2	6	6744	6749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
97	NC_018489	CAAT	2	8	6842	6849	50 %	25 %	0 %	25 %	402558815
98	NC_018489	ATG	3	9	6988	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558815
99	NC_018489	ATC	2	6	7049	7054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
100	NC_018489	CTT	3	9	7075	7083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
101	NC_018489	TAC	2	6	7217	7222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
102	NC_018489	CTT	2	6	7257	7262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558815
103	NC_018489	CAT	2	6	7263	7268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558815
104	NC_018489	GAA	2	6	7287	7292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
105	NC_018489	AC	3	6	7338	7343	50 %	0 %	0 %	50 %	402558815
106	NC_018489	TTG	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558815
107	NC_018489	CTC	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558815
108	NC_018489	T	6	6	7396	7401	0 %	100 %	0 %	0 %	402558815
109	NC_018489	TGG	2	6	7409	7414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558815
110	NC_018489	AGA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
111	NC_018489	TAA	2	6	7468	7473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558815
112	NC_018489	TAA	2	6	7646	7651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558815
113	NC_018489	TAAA	2	8	7681	7688	75 %	25 %	0 %	0 %	402558815
114	NC_018489	CAAT	2	8	7696	7703	50 %	25 %	0 %	25 %	402558815
115	NC_018489	T	6	6	7722	7727	0 %	100 %	0 %	0 %	402558815
116	NC_018489	ATT	2	6	7797	7802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558815
117	NC_018489	GT	3	6	7813	7818	0 %	50 %	50 %	0 %	402558815
118	NC_018489	TA	3	6	7828	7833	50 %	50 %	0 %	0 %	402558815
119	NC_018489	AGA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
120	NC_018489	AGA	2	6	7877	7882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558815
121	NC_018489	TTTG	2	8	8680	8687	0 %	75 %	25 %	0 %	402558816
122	NC_018489	AT	3	6	8704	8709	50 %	50 %	0 %	0 %	402558816
123	NC_018489	AT	3	6	8786	8791	50 %	50 %	0 %	0 %	402558816
124	NC_018489	ATA	2	6	8795	8800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558816
125	NC_018489	ATT	2	6	8807	8812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558816
126	NC_018489	TAA	2	6	8814	8819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558816
127	NC_018489	TCG	2	6	8824	8829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558816
128	NC_018489	TAA	2	6	8848	8853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558816
129	NC_018489	ATG	2	6	8898	8903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558816
130	NC_018489	GA	3	6	8962	8967	50 %	0 %	50 %	0 %	402558816
131	NC_018489	TAGA	2	8	9000	9007	50 %	25 %	25 %	0 %	402558816
132	NC_018489	ATGA	2	8	9026	9033	50 %	25 %	25 %	0 %	402558816
133	NC_018489	TATAAA	2	12	9074	9085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558816
134	NC_018489	A	6	6	9118	9123	100 %	0 %	0 %	0 %	402558816
135	NC_018489	GTT	2	6	9950	9955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558817
136	NC_018489	CATA	2	8	9961	9968	50 %	25 %	0 %	25 %	402558817
137	NC_018489	TAAT	2	8	10036	10043	50 %	50 %	0 %	0 %	402558817
138	NC_018489	ATG	2	6	10095	10100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558817
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.